由于對(duì)細(xì)菌和病毒很恐懼，所以市場(chǎng)上宣傳以除菌為主的凈水器很受消費(fèi)者歡迎。但如果使用的水源是自來水的話，除菌則是選購(gòu)凈水器最大的概念誤區(qū)。因?yàn)樽詠硭淹都恿俗阋詺缢屑?xì)菌的氯氣，且末梢自來水的余氯含量不低于國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)0.05mg/L，完全可以保證用戶水龍頭出水不含任何細(xì)菌。

相反，對(duì)市場(chǎng)上某些凈水器進(jìn)行的檢測(cè)結(jié)果表明，使用幾天后，如果不進(jìn)行反沖洗，本來合格的自來水流過凈水器后細(xì)菌總數(shù)將遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過飲用水標(biāo)準(zhǔn)范圍。既使定時(shí)進(jìn)行反沖洗，隨著使用時(shí)間的增加，細(xì)菌含量也會(huì)逐漸升高直至超標(biāo)，并且，其去除有害物質(zhì)的能力也逐漸下降，當(dāng)出水量超過凈水器的額定凈水量后，有害物質(zhì)還會(huì)釋放到水中。

美國(guó)聯(lián)邦環(huán)保署曾警告使用凈水器的消費(fèi)者要將水煮沸后再飲用，其主要目的是殺滅由凈水器帶入水中的細(xì)菌。